A Secretaria de Meio Ambiente, Proteção e Bem-Estar Animal de Sorocaba foi criada em 2009. É o órgão executivo responsável pela proteção do sistema natural e pelo controle da qualidade ambiental no município. Os setores da secretaria estão divididos em três:
São também vinculados à Secretaria Municipal do Meio Ambiente:
- Conselho Municipal de Proteção e Bem-Estar Animal (CMPBEA)
É um conselho ligado à Secretaria do Meio Ambiente e Sustentabilidade (Sema), formado por representantes do Poder Público e da sociedade civil.
Seu objetivo é orientar e auxiliar a Sema e outros órgãos na criação e execução de políticas públicas de proteção e defesa dos animais.
- Fundo do Meio Ambiente (FAMA)
É um fundo contábil utilizado exclusivamente pela Sema para administrar recursos destinados a programas e projetos ambientais. Os recursos são utilizados, entre outras ações, para preservar e conservar os ecossistemas, manter os parques ecológicos e desenvolver atividades de educação ambiental.